اینک می‌پردازیم به ذکر قسمتی از تألیفات و تحقیقات استاد «آل اسحاق»:
۱- بررسی مذاهب و ادیان.
۲- تبیین اسلام و یا خداشناسی انبیاء (شامل ۲۰ مقاله).
۳- ایمان و انسان (شامل ۳۰ مقاله).
۴- منطق ما یا آفات شناخت (شامل ۳۵ مقاله).
۵- انواع و اشکال شناخت (شامل ۴۰ مقاله) که در تاریخ ۳۰/۱۰/۱۳۶۲ چاپ و منتشر گردید و کتب ردیف یک تا چهار، سال‌ها قبل انتشار یافته‌اند. کتب زیر تاکنون به چاپ نرسیده است:
۶- موانع شناخت (شامل ۴۰ مقاله) آمادۀ چاپ
٧- دروغ‌های بزرگ، وجود و وحدت وجود آمادۀ چاپ
۸- دروغ‌های بزرگ، موجود و وحدت موجود آمادۀ چاپ
٩- دروغ‌های بزرگ، تکامل داروینی آمادۀ چاپ
۱۰- دروغ‌های بزرگ، روح مجرد فلسفی آمادۀ چاپ
۱۱- حسین، حسین است، نه یاحسین است و نه واحسین است.
۱۲- علی، علی است، نه یاعلی.
۱۳- انواع و اشکال شرک‌ها.
۱۴- بدعت‌ها در دین (منظوم).
۱۵- پاسخ به سؤالات دینی.
۱۶- تربیت اسلامی.
همچنین وی به تألیفی عظیم در بارۀ قرآن کریم اقدام کرد که در هشت بخش اصلی تنظیم گردیده است:
الف: بخش اول موسوم به عالم القرآن که خود به پنج فصل منقسم است:
۱- مقدمه بر عالم القرآن.
۲- رُنسانس عظیم در تفکرات اسلامی یا بدایة الاسلام با استناد به ۳۰۰ آیۀ قرآن.
۳- قسمت اول نهایة الإسلام با استناد به ۱۰۰۰ آیۀ قرآن.
۴- قسمت دوم نهایة الإسلام با استناد به ۱۲۰۰ آیۀ قرآن.
۵- قسمت سوم نهایة الإسلام با استناد به ۱۵۰۰ آیۀ قرآن.
ب: بخش دوم تحت عنوان الله القرآن که به پنج فصل منقسم است:
۱- الله القرآن.
۲- صفات الله فی القرآن.
۳- توحید الله فی القرآن.
۴- أفعال الله فی القرآن.
ج: بخش سوم تحت عنوان نُبُوُّة القرآن که به دو فصل منقسم است:
۱- نبوت عامه.
۲- نبوت خاصه.
د: بخش چهارم آخِرَةُ القرآن که به چهار فصل منقسم است که در آن به ۱۰۰۰ آیۀ قرآن استناد گردیده:
۱- محشر و قیامت.
۲- بهشت.
۳- أعراف.
۴- جهنم.
هـ: بخش پنجم تحت عنوان عدالة القرآن که دارای دو فصل است:
۱- عدالة الله.
۲- عدالت اجتماعی و عدالت در مورد انسان.
و: بخش ششم تحت عنوان إِمامة القرآن که دارای دو فصل است:
۱- امامة الشیعة.
۲- إِمامة العامة.
ز: بخش هفتم موسوم به اخلاق القرآن با استناد به ۱۲۰۰ آیۀ قران، ۳۰۰ موضوع اخلاقی در قرآن با اخلاق فلسفی و عرفانی متصوفه مقایسه شده است.
ح: بخش هشتم تحت عنوان احکام القرآن در دو فصل:
۱- محرمات.
۲- واجبات.
همچنین استاد، حدود ۱۶ مقاله در مورد مطالب قرآن دارد که عناوین برخی از آن‌ها را در اینجا می‌آوریم:
۱- التعبد والعبادة فی القرآن.
۲- الاستعانة فی القرآن.
۳- الهدایة فی القرآن.
۴- الصراط الـمستقیم فی القرآن.
۵- الشیء فی القرآن.
۶- الخِلقَة فی القرآن.
٧- الخلیفة والخلافة فی القرآن.
۸- التقدیس والتقدس فی القرآن.
٩- التعقل والعقل فی القرآن.
۱۰- الظن والظنون فی القرآن.
۱۱- بنی إسرائیل فی القرآن.
۱۲- الشفاعة فی القرآن.
۱۳- الدعاء فی القرآن.
۱۴- الولایة فی القرآن.
۱۵- التطهیر فی القرآن.
۱۶- الإصطفاء فی القرآن.
۱٧- الرُّسل فی القرآن.
۱۸- الإتباع عن الرسول فی القرآن.
بعضی از موضوعات فوق به تنهایی یک مجلد است، و برخی ۲ یا ۳ موضوع در یک مجلد قرار می‌گیرد.